mac での biopython のインストール

mac python

macports に py25-biopython はあるのですが、最新バージョンは1.48に対し、これのバージョンは1.44です。というわけで以下のような感じで入れるといいのではないでしょうか。 python2.5.2 のインストールまず macports でpythonをインストールします。 sud…

2008-09-28

macportsでSICP(のtexi)のインストール

mac

してみました。 kozo_ni$ sudo port install sicp 下記の場所に入っているようです。 /opt/local/share/info/sicp-1.gz /opt/local/share/info/sicp-2.gz /opt/local/share/info/sicp-3.gz /opt/local/share/info/sicp-4.gz /opt/local/share/info/sicp-5.gz…

2008-09-28

ipythonについて

python

ipython を初めて起動すると以下のようなメッセージが出ます。(これは mac です) 暇ができたら気にしようと思います。 Welcome to IPython. I will try to create a personal configuration directory where you can customize many aspects of IPython's fu…

2008-09-27

mercurial.el について

emacs

mercurial.el の中身を見ていると下記のような記述がありました。 ;; As of version 22.3, GNU Emacs's VC mode has direct support for ;; Mercurial, so this package may not prove as useful there. というわけで M-x vc-なんとかを試してみたのですが…

2008-09-27

macportsでmercurialのインストール

mac

kozo_ni$ sudo port install mercurial +bash_completion +zsh_completion で入れました。 /opt/local/share/mercurial/contrib/bash_completion /opt/local/share/mercurial/contrib/zsh_completion がvariants付けた成果なんでしょうか。加えて何か設定し…

2008-09-26

expatのビルド時に出たメッセージ

linux

以下のようなメッセージ出ました - Libraries have been installed in: /usr/local/lib If you ever happen to want to link against installed libraries in a given directory, LIBDIR, you must either use libtool, and specify the full pathname of th…

2008-09-25

macportsでのRのインストールについて

mac

一度macportsからRを入れようと思い立ち、依存しているものをXFree86を除いてすべてmacportsで入れたのですが、最後で以下のエラーが出て通りませんでした。 checking for X... no configure: error: --with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not a…

2008-09-25

シェルについて

mac linux

最近zshじゃなくてもいいか、と思うようになりmacportsでbashとbash-completionを入れました。 bash-completionを入れた際には下記のメッセージがでたのでメモ。 > Installing bash-completion 20060301_1 To use bash_completion, add the following lines …

2008-09-25

macportsでのXFree86のインストールについて

mac

ここ http://xquartz.macosforge.org/trac/wiki のX11を入れたあとmacportsでXFree86を入れようとすると下記のメッセージが出ました。(ターミナルの表示通りにインデントされてませんが) kozo_ni$ sudo port install XFree86 > Fetching XFree86 Error: Targ…

2008-09-07

macでのeasy_installのインストールについて

python

WEB+DB PRESS Vol.46の [速習]Python をざっと読みました。本の中ではez_setup.pyをダウンロードして python ez_setup.py とやってeasy_installコマンドを使えるようにしていますが、macportsを使ってる場合であれば下記のようにしてもいいと思います。 sud…