2010-01-01から1ヶ月間の記事一覧

biopythonでswissprotのレコードをパースする

意味無くSwissprotの ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/uniprot_sprot.dat.gz からデータをダウンロード,解凍しパースしましょう. from Bio import SwissProt records = SwissProt.parse(open("unipro…

ubuntu に datamapper を入れる時は

gem install do_sqlite3をやる前に sudo aptitude install libsqlite3-devをやる

梅.py 新年会 と今年の抱負

今日は 梅.py [梅田でごはん。] 新年会(?) に参加してました。 場所は天神橋5丁目の玉一という韓国焼肉屋でした。参加者は僕と @whosaysni さん, @lab1092 さん, @kfuruhata さん[twitterアカウント]の4人でした。どんな話をしていたかというと - Blenderに…