cytoscape retreat (CyOog)

• PPIとかTFと他の遺伝子のinteractionネットワークのクラスタリング
  • ウインドウスライドでパラメーターが調節でき、それに応じてリアルタイムでクラスタリングが変わる。(エッジのcollapseがリアルタイムで変わる)
• bipartite regulatory networks(TFとのinteraction network)
  • poorly characterizedな遺伝子YAP7の特徴付け
• Homology network(Blastのe-valueの閾値10-e47位だった希ガス)
  • domain interactionを見るみたいな感じだった

まとめ
かなりおもろそう。絶対使ってみる。

http://www.biotec.tu-dresden.de/schroeder/group/powergraphs

PLoSの論文になってる。
http://www.ploscompbiol.org/article/fetchArticle.action?articleURI=info:doi/10.1371/journal.pcbi.1000108